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平成26年度申請実績および採択利用課題

採択情報

平成29年度平成28年度平成27年度平成26年度平成25年度平成24年度平成23年度平成22年度平成21年度

平成26年度申請実績

利用区分 カテゴリー 応募数 採択数
学術利用 成果公開 22 22
産業利用 成果公開 10 10
成果非公開 12 12
社会貢献利用 成果公開 0 0
成果非公開 0 0
合計 44 44

平成26年度採択利用課題一覧 (学術利用)

番号 所属機関 申請課題名 (課題概要) 利用区分
(カテゴリー)
利用 口数 報告書
1 理化学研究所計算科学研究機構 高性能・高生産性を達成する垂直統合型アプリケーションフレームワーク 学術利用
(成果公開)
2 PDF
2 独立行政法人海洋研究開発機構 福島原発事故由来の硫黄放射性同位体モデルを用いた硫酸塩エアロゾルの動態の解明 学術利用
(成果公開)
9 PDF
3 東京大学情報理工学系研究科 ポストペタ時代の大規模並列数値計算のための技術開発 学術利用
(成果公開)
3 PDF
4 九州大学カーボンニュートラル・エネルギー国際研究所 多相流LBMシミュレーションの大規模間隙モデルへの適用 学術利用
(成果公開)
6 PDF
5 都城工業高等専門学校 超電導電力ケーブルの交流損失解析 学術利用
(成果公開)
1 PDF
6 京都大学 知識に基づく構造的言語処理の確立と知識インフラの構築 学術利用
(成果公開)
23 PDF
7 京都工芸繊維大学 超大規模フェーズフィールドGPU計算によるデンドライト競合成長メカニズムの解明Ⅱ 学術利用
(成果公開)
8 PDF
8 千葉工業大学 結晶構造中における有機蛍光色素の光物性 学術利用
(成果公開)
2 PDF
9 大阪府立大学 多孔体界面乱流の直接数値計算 学術利用
(成果公開)
5 PDF
10 首都大学東京
理工学研究科
TSUBAME2 GPUによるスピン系のクラスターアルゴリズム・モンテカルロシミュレーション 学術利用
(成果公開)
2 PDF
11 慶應義塾大学
理工学部
仮想GPUを用いた分子動力学シミュレーションコードの開発と評価 学術利用
(成果公開)
8 PDF
12 理化学研究所計算科学研究機構 GPU を用いた気象・気候アプリケーションライブラリの開発 学術利用
(成果公開)
1 PDF
13 桐蔭横浜大学 ATP加水分解によって惹き起こされるミオシン分子モーターの偏った揺らぎ運動に関する分子動力学シミュレーション 学術利用
(成果公開)
1 PDF
14 東京大学大学院情報理工学系研究科 高性能と高生産性を両立する並列分散ランタイムシステム 学術利用
(成果公開)
5 PDF
15 東京大学大学院情報学環・地震研究所 不均質地球構造における地震波・津波伝播シミュレーション 学術利用
(成果公開)
1 PDF
16 大阪府立大学 分子動力学法によるナノ間隙内流動特性の解明 学術利用
(成果公開)
1 PDF
17 理化学研究所計算科学研究機構 ミニアプリケーションの開発 学術利用
(成果公開)
2 PDF
18 大阪大学蛋白質研究所 転写サイクルを制御する蛋白質複合体ダイナミクスの解析 学術利用
(成果公開)
24 PDF
19 東京医科歯科大学 難治疾患研究所 低分子化合物とタンパクとの相互作用の計算 学術利用
(成果公開)
5 PDF
20 成蹊大学 高性能計算向け分散メモリ・ストレージ統合システムの研究 学術利用
(成果公開)
1 公開延期
21 情報通信研究機構 GPUクラスタを利用した詳細人体モデルの大規模電磁界計算 学術利用
(成果公開)
1 PDF
22 東京大学 工学系研究科 ナノ構造界面における熱輸送特性の分子シミュレーション 学術利用
(成果公開)
2 PDF

平成26年度採択利用課題一覧 (産業利用)

番号 所属機関 申請課題名 (課題概要) 利用区分
(カテゴリー)
利用口数 報告書
1 清水建設株式会社 気象イベントを考慮した建築環境の解析評価 産業利用
(成果公開)
10 PDF
2 新日鐵住金株式会社 鋼中析出物の水素捕捉能の高精度計算 産業利用
(成果公開)
50 PDF
3 武田薬品工業株式会社医薬研究本部 拡張アンサンブルシミュレーションによるタンパク質とリガンドの結合構造予測の展開 産業利用
(成果公開)
10 PDF
4 太陽誘電株式会社 電子デバイス材料の計算機設計 産業利用
(成果公開)
16 PDF
5 株式会社JVCケンウッド TSUBAME2.5利用による大規模な光の波面伝搬計算 産業利用
(成果公開)
2 PDF
6 住友化学株式会社先端材料探索研究所 理論計算に基づく有機半導体材料の開発 産業利用
(成果公開)
10 PDF
7 TOTO株式会社
技術開発センター
衛生陶器混相流シミュレーションの商品設計および販促への展開 産業利用
(成果公開)
20 PDF
8 トヨタ自動車株式会社 塗工スラリーの分子シミュレーション 産業利用
(成果公開)
30 PDF
9 株式会社パナソニックシステムネットワークス開発研究所 ワイヤレス電力伝送による漏えい電波の環境解析技術の研究開発 産業利用
(成果公開)
12 PDF
10 スタッフ株式会社 大容量データ伝送用ミリ波アンテナのレドームに関する基礎検討 産業利用
(成果公開)
2 PDF

平成26年度採択利用課題一覧 (産業利用:成果非公開)

番号 所属機関 申請課題名 (非公開) 利用区分
(カテゴリー)
利用
口数
状況
1 富士通アドバンストテクノロジ株式会社 (非公開) 産業利用
(成果非公開)
非公開 終了
2 株式会社 構造計画研究所 (非公開) 産業利用
(成果非公開)
非公開 終了
3 信越化学工業株式会社 (非公開) 産業利用
(成果非公開)
非公開 終了
4 コニカミノルタ株式会社 (非公開) 産業利用
(成果非公開)
非公開 終了
5 株式会社クレハ (非公開) 産業利用
(成果非公開)
非公開 終了
6 アイシン・エィ・ダブリュ株式会社 (非公開) 産業利用
(成果非公開)
非公開 終了
7 トヨタ自動車株式会社 (非公開) 産業利用
(成果非公開)
非公開 終了
8 協和発酵キリン株式会社 (非公開) 産業利用
(成果非公開)
非公開 終了
9 株式会社リコー (非公開) 産業利用
(成果非公開)
非公開 終了
10 セイコーインスツル株式会社 (非公開) 産業利用
(成果非公開)
非公開 終了
11 株式会社豊田自動織機 (非公開) 産業利用
(成果非公開)
非公開 終了
12 トヨタ自動車株式会社 (非公開) 産業利用
(成果非公開)
非公開 終了

利用課題概要

組織名 : 大阪府立大学
申請課題名 多孔体界面乱流の直接数値計算
利用課題概要   多孔体は,医療,環境工学のみならず,工業製品においては燃料電池内のガス拡散層,熱交換器,触媒装置などで見られる.したがって,多孔体内外の流動現象を理解することは,これら工業製品の設計において重要である.しかし,多孔体内外の乱流現象は,多孔体構造の影響を強く受け,複雑な流動となる,とりわけ,多孔体壁表層の乱流現象は,滑面での現象と大きく異なることが報告されている.しかし,微細な構造をもつ多孔体内部は実験的計測が難しく,構造の複雑さゆえ,数値計算における乱流解析も十分に行われていない.そのため,多孔体表層の乱流生成・輸送現象の詳細なメカニズムは未だ分かっていない.そこで,本研究では,複雑境界の取り扱いが容易で,高精度乱流解析が可能な格子ボルツマンを用いて,チャネルの下面に多孔体を敷き詰めた,多孔体チャネル乱流の直接数値計算を行う.そこでは,微細な多孔質の構造を正確に解像して構造の違いによる乱流構造の変化を捉えることを主眼におく,そして得られた結果をもとに,多孔体界面表層の詳細な乱流渦構造を調べ,多孔体内部の乱流方程式の収支解析を行うことで,乱流の生成・輸送機構を調べる. 
組織名 : 京都工芸繊維大学
申請課題名 超大規模フェーズフィールドGPU計算によるデンドライト競合成長メカニズムの解明Ⅱ
利用課題概要   本研究課題は,科学研究費助成事業(基盤研究(B))「超大規模フェーズフィールドGPU計算によるデンドライト競合成長メカニズムの解明」(平成25~27年度)の下で行われるものである.材料強度を支配する材料組織は,凝固プロセスにおけるデンドライトの成長によって創生される.しかしながら,デンドライト凝固組織の3次元構造形成メカニズムは,実験観察の困難さもあり未だに解明されていない.本研究では,フェーズフィールド法によるGPUスパコンを用いた超大規模計算法を構築し,二元合金の一方向凝固計算を体系的に行うことで,3次元デンドライト競合成長メカニズムを世界で初めて解明する.本年度は,昨年度構築したコードを用いた一方向凝固過程における3次元競合成長シミュレーションを行い,3次元状態における新しい淘汰現象の解明を図る.また,二元合金凝固の定量的シングルフェーズフィールドモデルと格子ボルツマン法を用いた対流内でのデンドライト凝固モデルを構築し,強制対流および自然対流がデンドライト形態に及ぼす影響を評価可能とする大規模シミュレーションコードを作成する. 
組織名 : 首都大学東京 理工学研究科
申請課題名 TSUBAME2 GPU によるスピン系のクラスターアルゴリズム・モンテカルロシミュレーション
利用課題概要   本研究では、格子スピン系に対し、複数のGPUを使った大規模なクラスターアルゴリズム・モンテカルロシミュレーションの開発を行う。多体系の物理的性質の研究法としてモンテカルロ法が標準的な手法として広く用いられているが、シングルスピンフリップ法には転移温度付近で緩和時間が急激に大きくなるなどの問題があり、解消する手法としてクラスターアルゴリズムが提唱されている。近年、GPUを用いた計算の高速化が研究され、シングルスピンフリップ法に関しては、数十倍の加速が報告されているが、クラスターアルゴリズムへのGPUの利用は始まったばかりである。申請者のグループは、1個のGPUを用いたクラスターアルゴリズムの効率的な計算方法を開発し、ライブラリーとして公開している[ http://cpc.cs.qub.ac.uk/summaries/AERM_v1_0.html ]。さらに、TSUBAME2システムを利用して、MPI並列により複数のGPUの計算に拡張することに成功した。これらの計算については、TSUBAME ESJ Vol.7 に解説記事を掲載しているが、今年度は多くの問題に応用していく。 
組織名 : 理化学研究所生命システム研究センター
申請課題名 GPUによる高速化を利用した計算分子設計
利用課題概要   近年では標的タンパク質に強く結合する ”低分子化合物” を設計する技術として計算機を利用する分子設計技術が広く用いられている。しかし、ペプチドなどの ”非” 低分子化合物を対象とした分子設計にこれらの技術をそのまま適用することは難しい。 本課題では、低分子化合物より大きな分子群を対象とした分子設計技術の開発を目指す。このような分子群はより大きな分子内自由度を持つため、莫大な計算処理能力が必要となる。また物性の面でも異なるため、より複雑な評価関数が必要となり、これも大きな計算処理能力を要求する。そこで我々はGPUが持つ計算処理能力を利用して問題の解決にあたる。GPU を利用するプログラム開発や、実際のタンパク質を対象としたスクリーニングテストを実行し、低分子化合物より大きな分子群を対象とした計算分子設計技術の確立を目指す。 
組織名 : 理化学研究所計算科学研究機構
申請課題名 GPU を用いた気象・気候アプリケーションライブラリの開発
利用課題概要   ポストペタスケールにおける気象・気候シミュレーションにおいて、ヘテロジーニアスな構成の並列計算機の性能を引き出し、有効活用することが命題になっている。一般的に気象シミュレーションのコードは用いる変数の数、データ量共に多く、かつアルゴリズムの要求B/F 比が高いという特徴を持っている。またプログラム規模が大きく書き換えには困難を伴う。少ない工数でGPU の利用を加速するOpenACC プログラミングモデルは、これらの問題を総合的に解決すると期待される。本研究では全球雲解像度モデルNICAM および高解像度LES モデルSCALE を対象とし、OpenACC を用いたGPU 最適化コードの実装を行い、GPU を用いた大規模並列計算の評価を行う。同時に、GPU 利用に適したアプリケーションフレームワークの検討と改良を行う。 
組織名 : 桐蔭横浜大学
申請課題名 ATP加水分解によって惹き起こされるミオシン分子モーターの偏った揺らぎ運動に関する分子動力学シミュレーション
利用課題概要   筋肉の収縮を蛍光顕微鏡で観ると、ミオシン繊維とアクチン繊維が入れ子構造をなしていて、ミオシン分子の頭部に取り込まれたアデノシン三リン酸(ATP)の加水分解がトリガーとなって、ミオシンがランダムな熱運動をしながらもアクチンを一方向に動かすことが分かっているが、ランダムな熱運動がどうやって方向性のある運動を生じさせるのかは明らかでない。われわれは先に、TSUBAME 2.0 を利用して、ミオシン頭部のATP ポケット周辺の原子にATP の加水分解で放出されるエネルギーを運動エネルギーとして配分することにより、ミオシン頭部全体の揺らぎ運動がどう変調されるか、100 ns の分子動力学シミュレーションを行った結果、ミオシン頭部は頸部との接合部を蝶番とするランダムな首ふり運動をするが、それが特に300 K の場合にはATP の摂動によって一方向に偏る傾向があるという結果を得た。ただ、対象としたホタテガイのミオシン分子構造(PDB:1kk7)の欠損部分を補綴する段階で、主鎖の一部が元々の構造と若干異なる構造となってしまったので、公開論文をまとめるに当たって、修正した初期構造からのシミュレーションを再度行い、完璧を期したいと考えている。 
会社名 : 杏林大学 保健学部
申請課題名 食品に含まれる抗酸化物質を対象とした多配座解析
利用課題概要   生体内において、抗酸化物質による抗酸化作用が健康に寄与しているといわれている。そこで食品に含まれる抗酸化物質の抗酸化プロセスを解明することで、これらのより効果的な摂取方法や食品加工方法等について新たな知見が得られると考えている。 本研究では量子化学計算を用いて、食品由来の抗酸化物質の構造について配座異性体も含めて明らかにし、抗酸化プロセスについて検討する。計算実験において、より精度の高い計算結果を得るためには、精度の高いモデルを用いる必要があるため、これらのモデルを用いた計算は指数関数的に計算コストが増大する。そこで、TSUBAMEの高度な計算資源を利用して精度の高い計算結果に基づいた検討を行いたい。 
組織名 : 理化学研究所計算科学研究機構
申請課題名 高性能・高生産性を達成する垂直統合型アプリケーションフレームワーク
利用課題概要   ポストペタスケールに向けた最重要課題である「並列性の克服」、「信頼性」、「低消費電力化」の解決に大きく貢献する高生産性垂直統合型ソフトウェアスタックの研究開発を行う。これはスケーラブルマルチスレッドランタイムを基盤としたドメイン特化型アプリケーションフレームワークであり、自動並列化、自動チューニング、耐故障性、電力最適化等の各種技術を透過的に内包する。我々は提案ソフトウェアスタック構成法を流体シミュレーション(CFD)および分子動力学法(MD)を対象として設計し、それらを最新の大規模ヘテロジニアススーパーコンピュータであるTSUBAME2を基盤として設計開発する。 
組織名 : 独立行政法人海洋研究開発機構
申請課題名 福島原発事故由来の硫黄放射性同位体モデルを用いた硫酸塩エアロゾルの動態の解明
利用課題概要   平成25-26年度(2013-2014年度) 新学術領域研究(研究領域提案型)公募研究の研究課題「福島原発事故由来の硫黄放射性同位体モデルを用いた硫酸塩エアロゾルの動態の解明」の一環として、TSUBAMEを用いて、硫黄放射性同位体(35S)の循環を導入した全球・領域3 次元大気輸送モデルを開発し、福島原発事故により放出された放射性セシウムの輸送媒体としての硫酸塩エアロゾルの動態の解明を行う。 
組織名 : 東京大学 情報理工学系研究科
申請課題名 ポストペタ時代の大規模並列数値計算のための技術開発
利用課題概要   TSUBAME, 京コンピュータなど,ペタフロップスを達成するスーパーコンピュータが広がってきている.今後さらなる性能向上が期待されているが,そのためには100万コア以上の並列性,深いメモリ階層,ネットワークの遅延などを手なずける必要がある.本研究ではこのような視点から,計算科学と計算機科学の融合・協力により次世代の超並列超高性能計算科学ソフトウェアの構成方式,アルゴリズム,実装技術を開発してゆく.本プロジェクトでは,ナノサイエンス,バイオインフォマティクス,コンピュータサイエンスの研究者の協力により,日本最大のGPU搭載スーパーコンピュータであるTSUBAMEを用いて,共同研究により次世代の計算機のためのアルゴリズム,並列化手法,最適化,プログラミングモデル,アプリケーションの新たな展開に関して研究を行う. 
組織名 : 九州大学 カーボンニュートラル・エネルギー国際研究所
申請課題名 多相流LBMシミュレーションの大規模間隙モデルへの適用
利用課題概要   二酸化炭素の地中貯留(CCS)は、岩石の間隙にCO2を注入することで永久的に地下に閉じ込めてしまう技術で、大気中のCO2の削減に貢献できる技術として注目されている。このCCSでは、間隙内部のCO2の挙動を調べることが重要であり、多くの実験が実施されている。さらにシミュレーションを用いることで、CO2を圧入する貯留層の条件を変えて、CO2の挙動を推定することが可能となる。本研究では、格子ボルツマン法を用いて、界面張力や粘性等のパラメータを変更しながら、岩石孔内のCO2挙動を明らかにする。GPUを用いて計算領域のサイズアップ(Max:2000×1000×1000 グリッド)を図り、これまでポアスケール(μmスケール)で行ってきた計算を、実験スケール(cmスケール)に拡張する。それにより、実験室で得られる結果と比較した議論が可能となる。また、実験室で得られるデータと比較することにより、シミュレーション結果の検証が可能となる。最終的に、貯留層の条件を変えたシミュレーションの結果から、CO2 圧入に適した貯留層の条件と、CO2の圧入方法を明らかにする。 
組織名 : 都城工業高等専門学校
申請課題名 超電導電力ケーブルの交流損失解析
利用課題概要   有限要素解析ソフトCOMSOLを使って超電導電力ケーブルの電磁界解析を行うことにより、交流損失の最小化設計を行う。超電導電力ケーブルは、1:10~1:2000と高い縦横比を持つ超電導テープから構成されており、電磁界解析のための要素数が非常に多くなる。また、この超電導テープは複数本フォーマ上に螺旋状に配置され、4層の導電層と2層のシールド層からなる。各層の螺旋ピッチを変えることにより各層に流れる電流を制御できるため、3次元電磁界解析により交流損失を最小化する螺旋ピッチの最適値を求める。 
組織名 : 神奈川大学
申請課題名 ユーザ間対等受付制御における大規模数値計算
利用課題概要   本研究課題においては、様々な要求帯域を持つストリーミング環境において,ユーザ全員の満足度を向上させるための受付制御の実現を目的とする.全ユーザ満足度を向上させるために,基礎検討として,異なる要求帯域(広帯域フローと狭帯域フローの二種類に分類)に対し,収容時に同じ満足度を得る(対等)と仮定し,広帯域フローを1本収容しない事で,狭帯域フローを複数収容可能とする受付制御方式を提案している.具体的には,全ユーザ満足度の最大化と等価である,網内への広帯域及び狭帯域フロー両者をあわせた呼損となる確率(トータル呼損率)を最小にする受付制御方式を提案する.制御を実現させるためには,制御パラメータで取りうる閾値に対して最適な値を導出する必要がある.
この最適な閾値を導出するために,本研究課題においては、定常状態を仮定し待ち行列理論を用いて解析を行う.しかし,最適な閾値導出のための,定常状態における状態方程式の解を導出するためには,大規模な行列計算が必要となる.そこで,TSUBAMEを用いた大規模並列処理により、これまで実現不可能であったトラヒック規模を持つ際の,最適な閾値を導出する. 
組織名 : 慶應義塾大学
申請課題名 仮想GPUを用いた分子動力学シミュレーションコードの開発と評価
利用課題概要   前年度から継続して分子動力学シミュレーションの大規模並列計算において重要になる長距離力の計算の高速化・並列化に関する手法を提案し、以下の2つのアプローチで性能評価と検討を行う。1つめは,継続して開発中のGPU仮想化ミドルウェアDS-CUDAの機能である「冗長計算機能」とGPU故障発生を想定した「プロセスマイグレーション機能」を拡充し,分子動力学シミュレーションを対象とした性能評価を行う. 本ミドルウェアは、単一計算ノード用に開発されたアプリケーションのソースコードを大規模分散コンピューティング環境でも利用可能にする機能を有し、分散コンピューティング環境でのプログラム開発を容易にする特徴をもつ.2つめは、Fast Multipole Method (FMM) を用いた分子動力学シミュレーションコードの開発である。既存のEwald和を用いた手法では大規模並列計算機を用いてもスケーラビリティの観点から解析が困難であった問題を解析可能にする。 これは、今後様々な分子動力学のアプリケーションソフトウェアが次世代の超並列計算機で性能を発揮する上で重要な役割を果たすと考えられる。 前年度は計算精度の解析に時間がかかり性能評価まで至れなかったため,今年度も継続して開発を行う. 
組織名 : 千葉工業大学
申請課題名 結晶構造中における有機蛍光色素の光物性
利用課題概要   有機蛍光分子は、鮮やかな発光性・多彩な色調可変性など、機能性色素としての優れた特性を持つため、エレクトロルミネッセンス素子・色素増感型太陽電池などの様々な用途が期待されている。このような分子を機能性材料として利用する場合、密に凝集させた固相状態としてデバイス化する必要がある。しかし、気相中や溶液中では強い発光性を持つ分子が、固相中では蛍光量子収率が著しく減少してしまうことも多々ある。また、結晶構造の違い(結晶多形)によって全く異なる発光効率・発色性・光感受性を示すことがあり、固体中における光物性の発現を予測できないことが問題であった。発光材料の光物性を意図的に制御して、用途に応じた機能性色素を自在に設計するためには、固相中における発光プロセスを詳細に解析するための新しい方法が不可欠である。そこで本研究では、結晶構造中における有機蛍光色素の光物性を理論的に予測するための方法を確立することを目指す。 
組織名 : 東京大学大学院情報理工学系研究科
申請課題名 高性能と高生産性を両立する並列分散ランタイムシステム
利用課題概要   分散メモリ並列計算機において現在主流のプログラミングモデルであるMPIは、並列アルゴリズムの開発に加えて、並列に実行可能な処理(タスク)と処理に必要なデータを適切な粒度に分割、各プロセッサに配置し、各プロセッサ間の通信処理を明示的に記述する必要がある。このような記述は、概して煩雑であり、並列プログラム開発の生産性を低下させる要因となっている。この問題に対して、当研究グループでは、大規模並列計算機上で、プロセッサへのタスク・データの配置を自動化するタスク並列処理系について研究・開発している。本利用課題では、提案するタスク並列処理系を構成する「軽量マルチスレッド機構」「大域アドレス空間機構」について、より高度なアルゴリズム・実装技術を研究・開発し、世界有数の性能を持つTSUBAMEを用いて性能評価を実施する。 
組織名 : 東京大学大学院情報学環・地震研究所
申請課題名 不均質地球構造における地震波・津波伝播シミュレーション
利用課題概要   3次元的に不均質な粘弾性構造中の地震波動伝播ならびに津波波動伝播の数値シミュレーションを実施する。陸海プレート境界地震や内陸活断層の地震に伴って放射される地震動が、不均質な地殻・上部マントルを伝播し、地殻表層部の軟弱な堆積層により強く増幅され、そして構造物に被害を引き起こす強震動が生成される一連の物理過程、また断層運動が海底を地殻変動によって動的に変動させ津波が生成・伝播し陸域に到達するまでの一連の過程運動方程式の大規模計算により理解する。 特に近い将来のヘテロジニアスな大規模計算機環境下での地震波動・津波波動伝播シミュレーションの実現を見据え、OpenACCやCUDAを用いたシミュレーションコードのGPU対応版開発およびその性能評価を行う。 
組織名 : 大阪府立大学
申請課題名 分子動力学法によるナノ間隙内流動特性の解明
利用課題概要   近年カーボンナノチューブ内を流れるガスや水が高速に流れることが報告されるなど,マイクロ・ナノオーダーにおける流動特性の特異性が注目されている.そのような流れはガス交換膜のようなマイクロ多孔質にも現れさらには,MEMS/NEMSやバイオ,医療,宇宙といった様々な分野での応用が期待されている.しかし,そのような流れ場を実験的に解明するのは難しいため,分子動力学法(MD)による数値シミュレーションが有効な手段である.そこで本研究では分子動力学法を用いて,カーボンナノチューブ内やグラフェンチャネル内部の流動解析を行うことで,炭素の六員環構造を持った壁面近傍での基本的流動特性について詳細に調べる.また,GPUを用いることにより,従来のCPUのみの計算機ではできなかった大きな計算領域の解析を行う. 
組織名 : 理化学研究所計算科学研究機構
申請課題名 ミニアプリケーションの開発
利用課題概要   平成25年度に理化学研究所と東京工業大学とで「将来のHPCI システムのあり方の調査研究アプリケーション分野」を実施した。その調査研究成果の一環としてミニアプリ集Fiberの整備および公開を進めている。本課題はミニアプリ集Fiberの大規模IntelプロセッサクラスタおよびGPUアクセラレータへの対応、性能評価、動作検証を目的としている。これはミニアプリの広い普及に不可欠であり、特に通常の小規模ワークステーションとは異なり大規模な計算およびデータを用いた評価を実施する。 
組織名 : 大阪大学蛋白質研究所
申請課題名 転写サイクルを制御する蛋白質複合体ダイナミクスの解析
利用課題概要   DNA 上に記された遺伝情報を読み取る転写の過程は、開始・RNA 鎖の伸長・終結という転写サイクルと呼ばれる段階からなっており、多数の転写因子とそれらの間の相互作用によって精緻に制御されている。 近年、種々の転写因子やRNAポリメラーゼの立体構造がX線結晶解析によって明らかにされたが、それらの因子間の動的な相互作用については未知のことが多い。特に、リン酸化によるアロステリックな制御が与える構造と相互作用への影響や、古細菌のRNA ポリメラーゼの動的なドメイン間相互作用について、長時間の分子動力学シミュレーションを行って解析する。 
組織名 : 東京医科歯科大学 難治疾患研究所
申請課題名 低分子化合物とタンパクとの相互作用の計算
利用課題概要   低分子化合物とタンパクとの相互作用の計算シミュレーションは創薬過程におけるヒット化合物の探索や、化合物最適化の段階で重要な情報となる。分子動力学等を用いた計算において、化合物とタンパクとの相互作用や、それによる構造変化を正確に推定するには比較的長時間でのシミュレーションが重要であり、そのために多くの計算リソースが必要である。本研究ではがん関連遺伝子の結晶構造情報を用いて、既知の活性化合物や候補化合物との相互作用、それによる構造・エネルギーの変化を分子動力学計算等のシミュレーションによって解析し活性化化合物のメカニズムを同定することが目的である。 
組織名 : 成蹊大学
申請課題名 高性能計算向け分散メモリ・ストレージ統合システムの研究
利用課題概要   現在、高性能計算において性能上大きなボトルネックになっているメモリアクセスについて、1 ノードの物理メモリサイズを超えるような大容量なデータに対しても高性能なアクセスを可能にするような記憶システムの構築を目的とする。各ノードにあるDRAM メモリ, SSD などを用い、複数ノードに分散した記憶資源を統合的に扱うためのソフトウエアシステムを設計、構築するための実装実験、性能評価を行う。特に記憶階層について着目し、各ノードの計算処理において、メモリアクセス局所性を生かすようなアルゴリズムを導入し、大規模サイズの問題に対して、多数ノードを用いて高速処理できるようにすることを目指す。応用分野は、当面、ステンシル計算、行列計算などの典型的な科学技術計算などとする。 
組織名 : 情報通信研究機構
申請課題名 GPUクラスタを利用した詳細人体モデルの大規模電磁界計算
利用課題概要   近年では,中間周波数帯(10kHz~10MHz)を利用した電子機器が増加しつつある。その電子機器の近傍にいる人体に対する電波の安全性を考えるとき,それらの電子機器から発する電波に対して,人体のどこにどれだけの電波エネルギーが吸収されているかを定量的に調べる必要がある。また中間周波数帯において,神経に対する刺激作用を防護するために,電波ばく露による人体内に誘発される内部誘導電界を評価する必要がある。そのために,詳細な人体モデルに対して,高速に吸収電力や人体内部誘導電界の解析を行い,ばく露評価を行う技術として,GPUを用いた詳細人体モデルの大規模電磁界解析を行う。本研究では,最小0.5mmの解像度を持つ詳細人体モデルを用いて,様々な電子機器から発する電波にさらされたときの吸収エネルギー分布を計算できるシミュレーション技術を確立する. 
組織名 : 東京大学 工学系研究科
申請課題名 ナノ構造界面における熱輸送特性の分子シミュレーション
利用課題概要   本研究では固体-固体間と固体-液体間を含む系の熱輸送特性に関する数値計算を多角的に行うことを目的としている.特に,熱電変換や沸騰・凍結など界面の微視的な熱輸送物性が系全体の伝熱に大きく影響する現象を対象に,第一原理計算,分子動力学計算,格子動力学計算,モンテカルロ計算,連続体計算を適材適所に組み合わせながら,マルチスケール熱・物質輸送解析を実施する.固体-固体間界面では,近年熱電変換の分野で成功を収めているナノ構造体が母材に埋め込まれた系に対して,密度汎関数法と格子動力学法,分子動力学法を用いて,界面フォノンモード解析を行う.これにより得られる界面フォノン透過関数を入力としたモンテカルロ計算を実施し,ナノ構造化バルク熱電変換材料の熱伝導特性を評価する.次に固体-液体間界面では,沸騰初期における気泡核生成メカニズムの解明に向けて,表面粗さや濡れ性などの表面物性が気泡核生成に与える影響を分子動力学法を用いて評価する.さらに,分子動力学計算結果をフェーズ・フィールド法に組み込み,沸騰のシミュレーションを行うことで,ナノ構造界面における熱輸送特性がマクロな沸騰現象に与える影響を検証する. 
組織名 : 高エネルギー加速器研究機構(KEK)
申請課題名 ヘテロ環境での大規模並列シミュレーションの研究
利用課題概要   大規模なシミュレーションを必要としている研究者にとって、プログラム開発環境と実行環境がシームレスであることが望ましいが、これまでは、自分の研究室のクラスターと大学などの機関にあるスーパーコンピュータを使い分けて研究を進めていた。シミュレーションに必要なデータが大規模であったり、利用環境のOSが異なるなど大きな障害となっている。このような不便を解消して、可能な限り、使える計算機資源を有効に連携して使う方法として、昨年度まで、行われたRENKEIプロジェクトの成果であるUniversal Grid User Interface(UGI)を使い、同プロジェクトで使われていたNAREGI環境を通して、Tsubame2の専用資源を利用して、放射線治療計画シミュレーションを行う。同シミュレーションは、放射線粒子が人体を通過するときの物理過程をモンテカルロ法で追跡し、人体の各部位での線量を計算する。計算に用いるプログラムは、Geant4と呼ばれ、原子レベルの物理過程を詳細に計算するため、膨大な計算時間が必要である。特に、新しい治療方法を開発する際には、詳細なシミュレーションが必要で、大規模なシミュレーションを効率よく実行できるユーザインターフェースも含めた環境を確立したい。 
組織名 : 京都大学
申請課題名 知識に基づく構造的言語処理の確立と知識インフラの構築
利用課題概要   テキストは、専門家によるデータの分析結果や解釈、ステークホルダーの批判・意見、種々の手続きや ノウハウなどが表出されたものであり、人間の知識表現の根幹である。テキストとして表現された知識を 計算機によって抽出・関連付けすることができれば、社会における知識循環を円滑化し、異なる分野間での知識の相互関連性の発見や、新しい知識・法則の発見を支援することが可能となる。言語情報処理はウェブをはじめとする大規模テキストの活用によって長足の進歩を遂げつつあるが、本利用課題ではこれをさらに発展させ、知識に基づく頑健で高精度な構造的言語処理を実現し、これによって様々なテキストの横断的な関連付け、検索、比較を可能とする知識インフラを構築する。 
組織名 : 量子化学研究協会研究所
申請課題名 並列計算機を利用したFC-LSE法による原子・分子のシュレーディンガー方程式の解
利用課題概要  シュレーディンガー方程式は、化学を始めとする物質科学における支配方程式であり、これを正確に解くことで様々な現象の量子レベルでの理解と予測が可能となる。我々はこれまでシュレーディンガー方程式をその方程式の本来の精度で解くための方法としてFree Complement Local Schrödinger equation (FC-LSE)法を開発してきた。
FC-LSE法のアルゴリズムは超並列計算に向いており、高い並列化効率が得られている。そこで本研究課題では昨年度に引き続き、これまでの計算機環境では現実的には求めることができなかった分子系に対し、TSUBAMEを用いてシュレーディンガー方程式を解き、一般の原子・分子の実際的な解法を確立したい。また、シュレーディンガー方程式の解(エネルギーと波動関数)だけではなく、そこから求められる諸所の物理量(Local Energy など)も計算したい。 
組織名 : 大阪大学蛋白質研究所
申請課題名 GPCR膜蛋白質の作動薬認識におけるダイナミクスの解析
利用課題概要  細胞膜上に存在するG蛋白質共役型受容体(GPCR: G-Protein Coupled Receptor)蛋白質は、細胞外のシグナル物質を認識し、作動薬の場合には細胞内での生体反応を促進する一方、阻害剤や逆作動薬では生体反応が抑制される。最近、種々のGPCRの結晶構造が明らかになるとともに、GPCRには活性型と不活性型とが存在し平衡状態にあることが判明したが、このダイナミクスの立体構造的な知見はほとんど得られていない。長時間の分子動力学シミュレーションを行うことにより、リガンド結合によっておこる活性型と不活性型の双方における構造のダイナミクスを調べる。 
組織名 : 名古屋工業大学
申請課題名 第一原理計算によるナトリウムイオン電池電極材料の相安定性
利用課題概要  リチウムイオン電池のコンセプトを引き継いだナトリウムイオン電池は、元素戦略の観点から大型電池用途に期待されている。しかし、研究開発期間が浅いことから、その電極反応に伴う材料の相安定性の詳細は不明な点が多い。 本研究では、ナトリウムイオン電池として有望な正極材料のうち、層状遷移金属酸化物材料(NaMO2)に着目し、密度汎関数に基づく高精度第一原理計算とモンテカルロ計算を組み合わせることで、電極反応過程における相安定性評価を行う。これにより、充放電反応に伴う結晶構造変化や電子構造変化を明らかにすることが可能になる。 
組織名 : 国立情報学研究所
申請課題名 マルチメディア内容解析に関する研究
利用課題概要  本研究では、映像等のマルチメディアコンテンツの主として視覚情報を解析し、その意味内容情報を自動抽出する手法について検討する。 
会社名 : 清水建設株式会社
申請課題名 気象イベントを考慮した建築環境の解析評価
利用課題概要   台風や竜巻・突風などの気象イベントによる人的,経済的ロスは極めて大きい.特に,竜巻では建物や鉄道施設に甚大な被害が発生しており,内閣府の防災基本計画にも風水害に係る事象として竜巻などの突風が明記され,竜巻の発生予測は先端科学技術の開発として重点的に取り組まれている.また,米国で2011 年に発生した竜巻は,多数の死傷者の発生に加えて原子力発電施設の稼働に影響を与えるなど,気象イベントは国際社会にも大きなインパクトを与えた.本利用課題は建築環境を対象にしてTSUBAME スパコンの計算資源利用や気象モデルの導入および広域建築環境の連携解析システムの整備を行い,既存の記録結果との比較によりこれらの気象ベントの特徴とその与える影響を調べ,局所的気象イベントを考慮した合理的な建築環境の構築を目指すものであ. 
会社名 : 新日鐵住金株式会社
申請課題名 鋼中析出物の水素捕捉能の高精度計算
利用課題概要   鋼材の水素脆化に影響を及ぼす微細析出物の水素捕捉機構解明のためのシミュレーションを実施する。具体的には、NaCl 型析出物のNbC について、その部分整合界面での水素捕捉能を第一原理計算によって見積る。これまで整合界面での水素捕捉能については、弊社において調べられてきたが、部分整合界面の水素捕捉能については計算規模が大きく、弊社内の計算機では計算することができなかった。平成25年度の共同利用において、NaCl 型析出物のNbC について部分整合界面での水素捕捉能の計算を実施し、大まかな傾向の把握に成功しており、その計算結果をベースに計算精度を向上させた計算を実施することを目的とする。 
会社名 : 武田薬品工業株式会社 医薬研究本部
申請課題名 拡張アンサンブルシミュレーションによるタンパク質とリガンドの結合構造予測の展開
利用課題概要  拡張アンサンブル分子シミュレーション法によりタンパク質とリガンドの結合構造、結合自由エネルギー、機能ダイナミクスを予測する手法の開発と検証をする。従来の手法では実験を置き換えるレベルに至っておらず、それを目指したシミュレーション手法のさらなる高精度化と検証が必要とされている。本利用課題では相互作用の物理化学的背景の理解に基づいた論理的な医薬品の分子設計を可能とするために、昨年度までに開発した二次元レプリカ交換法を膜タンパク質に対してより効果的に適用するために改良し、結晶構造解析困難な膜タンパク質に対しての有効性を示す。より複雑な水溶性タンパク質に対する検証も継続する。また、自由エネルギー計算との連携を強化し、結合モード予測から結合自由エネルギー予測をスムーズに実施できるようにする。さらにGPUを効率的に使用して、主成分解析などの手法を用いた機能性ダイナミクスの解析を試みる。 
会社名 : 太陽誘電株式会社
申請課題名 電子デバイス材料の計算機設計
利用課題概要   電子デバイスには様々な機能を有する材料が求められている。そこで用いられる固体無機材料はごくわずかな欠陥や不純物に起因する材料内部のナノレベルの構造変化によってその電子物性が大きく変化する事が知られており、また有機材料においてもデバイスに応じた原子レベルでの特性理解と分子構造設計が必要とされている。本利用課題では、実験のみのアプローチでは理解が困難なこれら原子レベルでの材料設計を計算機上で行い、その有効性を示す。 
会社名 : 株式会社JVCケンウッド
申請課題名 TSUBAME2.5利用による大規模な光の波面伝搬計算
利用課題概要   光の情報を忠実に再現できるホログラフィ技術は次世代の立体映像表示技術として期待されており、電子化による動画再生が可能なディスプレイの開発や静止画記録に関する研究が行われている。しかし一般的に光の波長オーダーでサンプリングされた情報を扱うことから、再生するための光の情報を計算する際にデータ量・計算量が膨大となり、映像のサイズやクオリティが大きく制限されている。本利用課題では、TSUBAME2.5の高い並列処理能力と潤沢なメモリ資源を有効に活用することで、大規模な光の波面伝搬計算およびホログラムデータの生成を実現する。生成されたデータは数値シミュレーション又は静止画のホログラム記録を介して妥当性を評価し、既存の制約を超えた立体映像表現を実現することを目的とする。 
会社名 : 株式会社構造計画研究所
申請課題名 三次元の広帯域地震動シミュレーションの実用化に向けた検討
利用課題概要  平成23年度の課題では3次元波動伝播プログラムをTSUBAMEに移植して最適化を行い、発生確率が高いと言われている東海・東南海・南海地震を対象とした大規模波動伝播シミュレーションを実施した。平成24年度は、強震動評価結果の工学的な妥当性、および耐震工学上重要な周期1秒以下の短周期地震動の計算精度の向上のための検討を行い、プログラムの実用化に向けた取り組み(平成25年度8月まで継続して行う計画)の一部を実施し、中間的な報告を行った。本課題では、引き続き実用化に向けた検討を実施する。 
会社名 : TOTO株式会社 技術開発センター
申請課題名 衛生陶器混相流シミュレーションの商品設計および販促への展開
利用課題概要  TOTOでは2017年環境ビジョン「TOTO GREEN CHALLENGE」を掲げ、全商品にわたる節水化およびそれに伴うCO2削減を強力に推進している。トイレ等の衛生陶器では、「GREENMAX」と銘打ち、「少ない水でもしっかり流す。」をコンセプトに商品を展開している。衛生陶器節水化の技術課題の一つとして、陶器表面に付着汚れを残さず洗い流すための効率的な流し方の確立が挙げられる。流体解析を用いることにより試作を繰り返すことなく様々な陶器形状や給水方法を事前検討できるが、陶器表面の薄膜の流れは気液二相流体解析では非常に細かいメッシュ分割および高精度な混相流計算手法が必要である。平成25年12月~平成26年3月の有償利用により、TSUBAME2.5においてあらゆる衛生陶器商品において薄膜陶器表面流れをシミュレートできるようになり、現在新商品設計等に活用している。次の課題として、洗浄時の陶器表面流れを含めた諸現象の評価検討を行うとともに、この技術を販売の第一線におけるお客様プレゼンツールとしても活用を検討する。 
会社名 : トヨタ自動車株式会社
申請課題名 塗工スラリーの分子シミュレーション
利用課題概要  スラリーの塗工は電池の電極作成などで広く行われている工業プロセスであり、微粒子・溶質・溶媒を基板の上に塗布した後に加熱して溶媒を蒸発させることで微粒子・溶質からなる多孔質体構造を得る。この工業プロセスを改善するためには、微粒子の表面改質や溶質・溶媒の分子構造の改良が重要であるが、現状は経験的・試行錯誤的なアプローチが一般的である。この問題に対し、本課題では、スラリーからの溶媒蒸発のシミュレーションを大規模な分子モデルにより実施し、溶媒・溶質分子種による形成構造の違いについて検討し、性能改善の指針を得ることを目的とする。 
会社名 : 株式会社パナソニックシステムネットワークス開発研究所
申請課題名 ワイヤレス電力伝送による漏えい電波の環境解析技術の研究開発
利用課題概要  近年、電波の利用方法としては、通信だけではなく、電力伝送技術が注目されている。2015年以降の実用化が予定されているワイヤレス電力伝送(WPT)システムとして、電気自動車用の大電力(数kW)を伝送するものや、家電機器用の中電力(数百W)を伝送するものなど、多種多様な方式開発が進められている。WPTシステムは、一般家庭や集合住宅への普及が見込まれており、使用範囲として住宅内に限らず屋外の駐車場も含めた広い空間が想定されており、そのような環境でWPTシステムを実現するには、WPTシステムから発生する漏えい電波が、近接する機器に与える影響を分析することが必須であるが、そのためには数十kHz~数GHzの周波数領域における漏えい電波の強度分布をシミュレーションにより評価する技術は確立する必要がある。そこで、本研究開発では、WPTシステムをはじめとする各種電子機器等が密集して設置された環境(住宅内等)における漏えい電波の発生源及び設置環境をモデル化して、漏えい電波の状況を分析できるシミュレーション技術を確立する。なお、本研究開発は、総務省委託研究開発「ワイヤレス電力伝送による漏えい電波の環境解析技術の研究開発」の一環として実施する。 
会社名 : スタッフ株式会社
申請課題名 大容量データ伝送用ミリ波アンテナのレドームに関する基礎検討
利用課題概要  近年モバイル端末の普及、およびコンテンツ情報量の増大に伴い、通信ネットワークトラフィックが爆発的に増大しているなか、ミリ波帯を使用した大容量のデータ伝送が可能な無線装置が注目されている。使用されるアンテナにおいては、通信距離の確保、通信の安定化などを実現する為に、アンテナに求められる性能は極めて高く、また屋外で使用するため、気象の悪条件も考慮したものが必要となる。本課題では、気象の悪条件からアンテナを保護する役割をもつレドームに注目、ミリ波帯におけるレドームの影響を電磁界解析で明らかにする。 
会社名 : 株式会社豊田中央研究所
申請課題名 Liイオン二次電池負極/被膜界面におけるLi 脱挿入過程に関するハイブリッド量子古典シミュレーション
利用課題概要   リチウム(Li)イオン二次電池では、電解質相を介して正極と負極の間でLi イオンが移動し、それに付随して種々の反応が進行することで充放電が行われる為、各反応過程の詳細を理解する必要がある。電極活物質や電解質材料に対しては実験・理論の両面からさまざまな解析が進められているが、電極界面反応はあまり明確にされていない。特に、負極界面には有機電解液の還元分解に伴って有機化合物と無機化合物から成る被膜(SEI)が形成されるため、負極/被膜界面反応のメカニズムを理解することは、高性能Li イオン二次電池の開発にとって重要となる。本利用課題では、負極/被膜界面におけるLi 移動と電気化学反応の詳細を、ハイブリッド量子古典法を用いて調べる。ハイブリッド量子古典シミュレーション法では、電子状態の変化が重要となる量子領域に密度汎関数法など高精度量子力学計算手法を適用し、量子領域を経験的相互作用モデルで表したシステム全体に埋め込んで計算を行う。従って大規模系の物質移動と化学反応の両方を取り扱うことができるため、界面におけるLi 移動反応を調べるのに適した手法である。 
会社名 : 株式会社風工学研究所
申請課題名 オープンソースコードによる風速の地形影響評価に関するLES
利用課題概要   地形の起伏がある場所に建築物を建てる場合には,建築基準法に基づき地形の影響による風の増速を評価する必要があるが,その評価手法や評価基準については明確な情報が示されていないのが現状である。近年,計算機資源が充実したことや数値流体解析技術が進歩したことにより,数値流体解析による風速の地形による影響評価が実施されるようになってきており,その実用化への期待が高まっている。本研究では,フリーソフトであるOpenFOAM を用いて変動成分まで予測可能なLES により,単純化した地形および複雑な起伏を有する実在地形を対象として変動成分まで含めた風速の予測を行う。LES は一般的に計算負荷がかなり高くなるが,TSUBAME2 の計算資源を利用することで大規模な並列化が可能となり,高解像度の解析格子を用いた解析が高速に実行されることが期待される。得られた解析結果を既往の風洞実験結果や観測結果と比較して計算精度の検証を行ったうえで,適切に解析を行うための解析モデルの作成方法や計算条件の整理を行い,適切な風速の地形影響評価のための解析を実施するための道筋を示すことを目的とする。 
会社名 : 住友化学株式会社先端材料探索研究所
申請課題名 理論計算に基づく有機半導体材料の開発
利用課題概要   理論計算に基づく新規有機半導体材料の設計・開発を目的とする。例えば、導電性高分子における伝導現象を理論的に解析し、実験結果と比較することによって、有用な知見を得、それを材料設計にフィードバックして開発を促進する。 

 

 

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